Shirou Emiya foi o único sobrevivente de um grande incêndio que causou milhares de mortes. Ele foi salvou por um grande feiticeiro que o adotou, chamado Kiritsugu Emiya. Após 10 anos, com a morte do seu tutor Shirou se tornou hábil para concertar qualquer tipo de objeto. Num dia Emiya estava saindo do colégio, quando o mesmo presenciou uma batalha entre dois servos, e ao tentar escapar da morte, ele acidentalmente invoca uma serva da Classe Saber. Emiya acaba por descobrir que entrou numa guerra entre os 7 maiores magos e seus respectivos servos Saber, Archer, Rider, Berserker, Lancer, Caster e Assasin), antigos heróis da humanidade reencarnados, para a conquista do Santo Graal. Será que Emiya conseguirá sobreviver a essa guerra?
" Fate Stay Night " foi baseado num jogo Hentai de mesmo nome produzido pela Typemoon, porém o anime não possui nenhuma cena de apelo sexual, mas com muitas lutas e uma historia cheia de reviravoltas.